Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Usp29Q9ES63 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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