Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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