Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Riok3Q9DBU3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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