Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tysnd1Q9DBA6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms