Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms