Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms