Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms