Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc7Q9D541 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ccdc7Q9D541 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7Q9D541 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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