Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc83Q9D4V3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms