Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt20Q9D312 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms