Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spns3Q9D232 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms