Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms