Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms