Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CRC3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CRC3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9CRC3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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