Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms