Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ergic3Q9CQE7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ergic3Q9CQE7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms