Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQ90 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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