Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gtf2ird2Q99NI3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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