Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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