Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms