Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms