Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dok4Q99KE3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dok4Q99KE3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dok4Q99KE3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dok4Q99KE3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dok4Q99KE3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dok4Q99KE3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dok4Q99KE3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dok4Q99KE3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms