Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms