Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms