Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx2ipQ8VC66 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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