Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms