Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms