Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms