Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms