Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Hpf1Q8CFE2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Hpf1Q8CFE2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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