Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms