Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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