Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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