Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms