Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms