Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Amigo1Q80ZD8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Amigo1Q80ZD8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Amigo1Q80ZD8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Amigo1Q80ZD8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Amigo1Q80ZD8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Amigo1Q80ZD8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms