Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClmQ7TSN2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms