Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb2Q78J03 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms