Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cspg5Q71M36 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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