Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms