Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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