Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms