Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mysm1Q69Z66 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms