Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Surf4Q64310 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms