Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc2Q62029 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms