Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms