Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms