Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms