Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms