Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eme2Q56A04 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eme2Q56A04 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms